S. pyogenes는 penicillin G에 대해 변함없이 감수성이 높다. 그러나 erythromycin에 대해서는 일부의 균주가 내성이고, 1991-1992년에 분리된 균주는 54%만이 tetracycline에 감수성이었다. S. pyogenes, S. agalactinae 및 S. pneumoniae에 대한 penicillin G의 MIC90를 비교해 보면, 각각 <0.008, 0.12 및 2ug/ml로 S. pneumoniae의 내성이 현저히 높다. 세브란스 병원에서 1985-1986년에 분리한 S. pneumoniae 30주 중에서는 1주 만이 penicillin G에 내성이었으나, 1990년에는 내성균주가 47%로 증가하였고, 1996년에는 80%이상이 내성이었다. S. pneumoniae 내성은 PBP의 변화로 인한 것이므로, penicillin 내성주 중에는 cefotaxime에 대해서도 내성인 것이 많으며, 이러한 균주에 의한 수막염은 치료가 어려운 것으로 알려져 있다. Penicillin 내성 S. pneumoniae 중에는 다른 계열약제인 clarithromycin이나 cotrimoxazole에도 내성인 균주가 많다.